Στις 3 Νοεμβρίου του 1898, μετά από 229 ολόκληρα χρόνια κατοχής, τα τουρκικά στρατεύματα αποχωρούν από την Κρήτη.
Είχαν προηγηθεί τον Αύγουστο του ίδιου έτους άγριες σφαγές του χριστιανικού πληθυσμού του Χάνδακα, εξέλιξη η οποία οδήγησε τις Μεγάλες Δυνάμεις στην απόφαση να απομακρυνθούν οι Οθωμανοί από το νησί.
Μετά την αποχώρηση των Τούρκων από την Κρήτη, ο έλεγχός της πέρασε στα χέρια των διοικητών των διεθνών στρατευμάτων:
Οι Βρετανοί έλεγχαν το Ηράκλειο, οι Ρώσοι το Ρέθυμνο, οι Γάλλοι το Λασίθι και οι Ιταλοί τα Σφακιά. Τελικά στις 9 Δεκεμβρίου του 1898 ο πρίγκηπας Γεώργιος της Ελλάδας φτάνει στο λιμάνι της Σούδας, όπου ο κρητικός λαός του επιφυλάσσει αποθεωτική υποδοχή, την ώρα που τα ευρωπαϊκά πολεμικά πλοία χαιρέτιζαν με κανονιοβολισμούς την ύψωση της σημαίας της Κρητικής Πολιτείας.
Η τουρκική κατοχή στην Κρήτη ξεκίνησε τον Αύγουστο του 1645 και κράτησε για 253 χρόνια. Πριν από το 1898 το Κρητικό Ζήτημα είχε ραγδαίες εξελίξεις με απανωτές εξεγέρσεις που εντάθηκαν μετά την επανάσταση του 1821. 20 χρόνια νωρίτερα και συγκεκριμένα το 1878, με την Σύμβαση της Χαλέπας, στην οποία συμμετείχε και ο Ελευθέριος Βενιζέλος, οι Κρητικοί πέτυχαν την δέσμευση του Σουλτάνου ώστε το νησί να αστυνομεύεται μόνο από Κρητικούς. Αυτό σήμανε και την ίδρυση της Κρητικής Χωροφυλακής, στην οποία μπορούσαν να γίνουν αξιωματικοί μόνο χριστιανοί.
11 χρόνια αργότερα, ο Σουλτάνος κατήργησε το συγκεκριμένο άρθρο και ανέθεσε στο συνταγματάρχη Ταξίν να αστυνομεύσει το νησί ως επικεφαλής ενός σώματος 200 ανδρών από τη Μακεδονία. Οι ταραχές ξεκίνησαν σχεδόν άμεσα, και το 1896, ο σουλτάνος υπό την πίεση των ξένων δυνάμεων δέχθηκε τη δημιουργία και αποστολή στο νησί σώματος 100 Μαυροβούνιων χωροφυλάκων, με διοικητή τον Άγγλο ταγματάρχη Μπορ.
Η ύπαιθρος ήταν υπό τον έλεγχο των επαναστατημένων Κρητικών ενώ οι πόλεις από τους Τούρκους. Οι Μεγάλες Δυνάμεις αποφάσισαν να στείλουν στόλους στο νησί για να βοηθήσουν στην εκτόνωση της κατάστασης.
Το 1898 οι Τούρκοι έκαναν άγριες σφαγές χριστιανών στο Ηράκλειο, κάτι που οδήγησε τους ξένους ναυάρχους να πάρουν την απόφαση για την απομάκρυνση των Τούρκων. Η τουρκική χωροφυλακή αποχώρησε πλήρως μαζί με τον τουρκικό στρατό, στις 3 Νοεμβρίου 1898, ενώ οι ναύαρχοι ανέλαβαν τη διοίκηση της Μεγαλονήσου.